宋真宗大中祥符年间，句容处士侯遗在茅山北麓首创茅山书院，在此讲学，授业生徒十余人。这是一家私立书院，一度只能自力更生，艰难办学，后来也曾得地方政府与朝廷的物质支持。此后院址屡迁，风雨飘摇，兴替更迭，命运多舛。先后存世240余年。学界历来有八大书院、六大书院与四大书院之说。其中所指书院对象虽然颇有出入，但茅山书院始终存诸众说之中。
宋初，久乱初平，政府无力兴复旧有的官学系统，有责任感的中国士人便自觉承担起培养人才、发展教育的职责。他们聚书山林，建院讲学，弥补了官学的不足。在这样的大环境下，句容处士侯遗在三茅山西北麓创建了茅山书院，侯遗遂成茅山书院之元老，发轫之功，永垂史册。
关于茅山书院创始人究竟是谁的问题，学界曾有二说：一指金坛人侯仲逸，一指句容人侯仲遗。最早记录侯仲遗创建茅山书院事迹的文献，是南宋的《庆元建康志》，可知“侯遗”与“侯仲遗”其实是同一人。“遗”即其名，“仲遗”即其字。之所以将侯仲遗误传为侯仲逸，大约是人们因为“遗”与“逸”二字形近而音同之故所致。
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