蛋白质消化的第一个部位是身体的“胃部”，胃部有着消化蛋白质特有的“胃蛋白酶”。
具体而看，蛋白质的消化过程主要分为两部分,首先是在胃里进行初步消化,胃蛋白酶初步分解蛋白质成多肽,然后在小肠里面，胰腺分泌的胰蛋白酶，胰糜蛋白酶,和小肠分泌的氨基肽酶,二肽酶等，以多种方式分步地将多肽链水解为氨基酸，氨基酸透过小肠绒毛上皮进入血液,被人体吸收.肠胃功能正常是保证蛋白质消化吸收的关键。
蛋白质在胃肠道中经多种蛋白酶及肽酶的共同作用，即由高分子物质分解为可被吸收的小肽(2~3个氨基酸)或氨基酸，并在小肠内被吸收，沿着肝门静脉进入肝脏。一部分氨基酸在肝内进行分解或合成蛋白质;另一部分氨基酸继续随血液分布到各个组织器官，合成各种特异性的组织蛋白质。故肝脏是蛋白质代谢的主要器官。
通常，人体消化道内的蛋白质是不可能全部被消化、吸收。未被消化的蛋白质和部分消化后又不易被肠壁吸收的蛋白质，在大肠内的细菌作用，发生腐败，产生有毒物质。其中，大部分随粪便排出体外，亦有少量被肠粘膜吸收，随血液运往肝脏，进行生理解毒，然后随尿排出，故人体不会因此发生中毒。如果，这些不易被肠壁吸收的蛋白质被少量吸收，即可能引起人体过敏反应，发生荨麻疹、湿疹、哮喘等病症。
中华人民共和国食品HACCP食品体系内部审核员
国家二级公共营养师
国家高级食品检验员 王思露
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